В 2006 году при кафедре миссиологии, катехетики и гомилетики СФИ создан Научно-методический центр по миссии и катехизации (НМЦ МиК). В своей работе центр следует основному направлению научно-исследовательской деятельности кафедры, которое заключается в изучении исторического опыта миссии, катехизации (оглашения) и проповеди в христианской церкви.

Центр опирается на многолетний практический опыт миссии и оглашения взрослых, начатый в 1970-е годы будущим ректором Свято-Филаретовского института священником Георгием Кочетковым. Сейчас этот опыт поддерживает основанное о. Георгием Преображенское содружество малых православных братств. Центр был создан для того, чтобы оказывать научно-методическую помощь православным миссионерам и катехизаторам, а также служить базой для их квалификационной подготовки.

На сегодняшний день основные направления работы НМЦ МиК — это научная работа и издание методической литературы. Центр также поддерживает работу интернет-портала, который создан в помощь православным священнослужителям и приходским миссионерам-катехизаторам.

Научно-методический центр не стремится разработать единую методику или универсальную форму катехизации. Его задача — анализ и систематизация существующей практики, создание пространства для диалога, обмена опытом и содействие возрождению в церкви святоотеческой традиции миссии и катехизации.